華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院生物信息系研究生導(dǎo)師：杜利凱

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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院生物信息系研究生導(dǎo)師杜利凱介紹如下：

杜利凱，男，博士，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)，信息學(xué)院，副教授，碩士生導(dǎo)師

電話：027-87280877

郵箱：dulikai@mail.hzau.edu.cn

工作單位：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院

研究方向：生物信息學(xué)

教育經(jīng)歷

2008年-2013年，山東大學(xué)，計(jì)算生物化學(xué)，理學(xué)博士

2004年-2008年，山東大學(xué)，化學(xué)，理學(xué)學(xué)士

主要職歷

2016年-至今，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)，信息學(xué)院，副教授，碩士生導(dǎo)師

2016年9月，臺(tái)灣交通大學(xué)，應(yīng)用化學(xué)系，訪問學(xué)者

2013年-2015年，中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所，助理研究員、副研究員

科研成果

主要圍繞復(fù)雜生物大分子的動(dòng)態(tài)行為和光動(dòng)力學(xué)現(xiàn)象結(jié)合高性能計(jì)算平臺(tái)展開研究。我們側(cè)重于發(fā)展包括新一代的分子間相互作用力場、動(dòng)力學(xué)方案，并結(jié)合高性能計(jì)算與數(shù)據(jù)挖掘突破現(xiàn)有理論模擬的瓶頸；發(fā)展適合的理論模擬方法，實(shí)現(xiàn)對生物大分子光激發(fā)過程的實(shí)時(shí)模擬，目前作為主要作者之一，設(shè)計(jì)編寫了JADE 程序包，完成了面向復(fù)雜分子體系激發(fā)態(tài)過程的動(dòng)力學(xué)方法的設(shè)計(jì)和改進(jìn)（https://github.com/jade-package），為復(fù)雜分子體系的激發(fā)態(tài)光化學(xué)研究提供了有效的研究工具。

近年主持的科研項(xiàng)目：

1. 國家自然科學(xué)基金青年基金，從頭算-插值的面跳躍動(dòng)力學(xué)方法及其在雙氧分子活化中的應(yīng)用，24.8萬，2016.1-2018.12

2. 省自然科學(xué)基金，鹵鍵及氫鍵在蛋白激酶抑制劑理性設(shè)計(jì)中的應(yīng)用研究，13萬，2015.9-2018.9

3. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)新進(jìn)教師啟動(dòng)基金， 若干重要蛋白激酶抑制劑分子作用機(jī)制研究，20萬，2016.1-2018.12

開發(fā)的部分開源程序包：https://github.com/dulikai

完整論文列表：https://www.researchgate.net/profile/Likai_Du

部分代表性論文（*為通訊作者）

Likai Du, Zhenggang Lan*, An on-the-fly surface-hopping program JADE for nonadiabatic molecular dynamics of poly-atomic systems: implementation and applications; J. Chem. Theory Comput., 2015, 11, 1360

Likai Du*, Cuihuan Geng, Dongju Zhang*, Zhenggang Lan*, and Chengbu Liu, Atomic Resolution Insights into the Structural Aggregations and Optical Properties of Neat Imidazolium-Based Ionic Liquids; J. Phys. Chem. B, 2016, 120, 6721

Likai Du, Zhenggang Lan*, Ultrafast Structural Flattening Motion in Photoinduced Excited State Dynamics of a Bis(dimine) Copper(I) Complex; Phys. Chem. Chem. Phys., 2016, 18, 7641-7650

Fang Liu, Likai Du*, Dongju Zhang, Jun Gao*, Performance of density functional theory on the anisotropic halogen•••halogen interactions and potential energy surface: Problems and possible solutions; 2016, 116, 710

Fang Liu, Likai Du*, Lili Wang, Jun Gao*, Chengbu Liu, Application of polarizable ellipsoidal force field model to pnicogen bonds; J. Comput. Chem., 2015 , 36, 441

Likai Du, Jun Gao*, Chengbu Liu*; A Polarizable Ellipsoidal Force Field for Halogen Bonds; J. Comput. Chem. 2013, 34, 2032 Likai Du, Jun Gao*, Yongjun Liu, Chengbu Liu*; Water-Dependent Reaction Pathways: An Essential Factor for the Catalysis in HEPD Enzyme; J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 11837

Likai Du, Jun Gao*, Yongjun Liu, Dongju Zhang, Chengbu Liu*; The Reaction Mechanism of Hydroxyethylphosphonate Dioxygenase: a QM/MM Study; Org. Biomol. Chem., 2012, 10, 1014

Jing Huang, Likai Du, Jun Wang, Zhenggang Lan*, Photoinduced Excited-State Energy-Transfer Dynamics of a Nitrogen-Cored Symmetric Dendrimer: From the Perspective of the Jahn–Teller Effect, J. Phys. Chem. C, 2015, 119, 7578

Jing Huang, Likai Du, De-Ping Hu, Zhenggang Lan*, Theoretical Analysis of Excited States and Energy Transfer Mechanism in Conjugated Dendrimers; J. Comput. Chem. 2015, 36, 151

Cuihuan Geng, Likai Du, Fang Liu, Rongxiu Zhu*, Chengbu Liu*, Theoretical study on the mechanism of selective fluorination of aromatic compounds with Selectfluor, RSC Adv., 2015, 5, 33385

Yanwei Li, Ruiming Zhang, Likai Du, Qingzhu Zhang, Wenxing Wang, Insights into the catalytic mechanism of chlorophenol 4-monooxygenase: a quantum mechanics/molecular mechanics study; RSC Adv., 2015; 5, 13871

Yanwei Li, Likai Du, Yueming Hu, Xiaomin Sun, Jingtian Hu*; Theoretical Study on the Aging and Reactivation Mechanism of Tabun-Inhibited Acetylcholinesterase by Using the Quantum Mechanical/Molecular Mechanical Method; Can. J. Chem., 2012,90, 376

Yang Wang, Likai Du, Jie Zhang, Shengyu Feng*; A Thermosensitive Supramolecular Aggregation from Linear Telechelic Polydimethylsiloxane with Self-assembly Units; J. Polym. Res., 2011, 18, 1635

Qianqian Hou, Likai Du , Jun Gao , Yongjun Liu *, and Chengbu Liu; QM/MM Study on the Reaction Mechanism of O6-Alkylguanine DNA lkyltransferase; J. Phys. Chem. B, 2010, 114, 15296

Jinghua Li, Likai Du, Lushan Wang*; Glycosidic-bond hydrolysis mechanism catalyzed by cellulase Cel7A from Trichoderma reesei: a comprehensive theoretical study by performing MD, QM, and QM/MM calculations; J. Phys. Chem. B, 2010, 114, 15261