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圖書簡介

《生物信息學(xué)》是在國內(nèi)資深生物學(xué)家與醫(yī)學(xué)專家的倡導(dǎo)下，經(jīng)全國高等醫(yī)藥教材建設(shè)研究會、衛(wèi)生部教材辦公室組織有關(guān)專家反復(fù)論證后決定組織編寫的。在教材的具體籌備和編寫過程中，全國高等醫(yī)藥教材建設(shè)研究會、衛(wèi)生部教材辦公室先后組織三次會議進(jìn)行研討。本書正是根據(jù)這些會議精神及專家的指導(dǎo)意見組織全國十余所大學(xué)的一線教師和學(xué)者共同努力編寫而成的。
全書共分為三篇十六章。第一篇生物信息學(xué)基礎(chǔ)；第二篇功能基因組信息學(xué)；第三篇生物信息學(xué)與人類復(fù)雜疾病。
目錄
緒論
第一節(jié) 生物信息學(xué)的興起
一、人類基因組計劃
二、生物信息學(xué)與組學(xué)
第二節(jié) 生物信息學(xué)在生命科學(xué)中的地位及意義
一、生物信息學(xué)內(nèi)涵
二、生物信息學(xué)在現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)發(fā)展中起著重要作用
第一篇 生物信息學(xué)基礎(chǔ)
第一章 DNA、RNA和蛋白質(zhì)序列信息姿源
第一節(jié) 引言
第二節(jié) 核酸序列數(shù)據(jù)庫
一、GenBank數(shù)據(jù)庫
二、EMBL數(shù)據(jù)庫
三、DDBJ數(shù)據(jù)庫
四、其他數(shù)據(jù)庫
第三節(jié) 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
一、PIR數(shù)據(jù)庫
二、MIPS數(shù)據(jù)庫
三、其他數(shù)據(jù)庫
第四節(jié) NCBI與EMBL-EBI
一、NCBI簡介
二、EMBL-EBI簡介
三、通過Entrez Gerle從NCBI獲取序列信息
四、通過SRS從EBI中獲取蛋白質(zhì)序列信息
小結(jié)
第二章 雙序列比對
第一節(jié) 引言
一、同源、相似與相同
二、相似性的定量描述
三、空格
第二節(jié) 替換記分矩陣
一、通過點矩陣對序列比較進(jìn)行記分
二、DNA序列比對的替換計分矩陣
三、蛋白質(zhì)序列比對的替換記分矩陣
第三節(jié) 雙序列比對算法
一、全局比對的經(jīng)典算法
二、局部比對的經(jīng)典算法
第四節(jié) 數(shù)據(jù)庫搜索
一、BLAST
二、數(shù)據(jù)庫搜索實例
第五節(jié) 比對的統(tǒng)計學(xué)顯著性
一、全局比對的統(tǒng)計學(xué)顯著性
二、數(shù)據(jù)庫搜索的統(tǒng)計學(xué)顯著性
第六節(jié) 參數(shù)的選擇
一、空格罰分參數(shù)
二、BLAST的參數(shù)
三、如何處理太多與太少的數(shù)據(jù)庫搜索返回
小結(jié)
……
第三章 多序列比對
第四章 序列特征分析
第五章 分子進(jìn)化分析
第六章 表達(dá)序列分析
第七章 基因芯片數(shù)據(jù)分析
第二篇 功能基因組信息學(xué)
第八章 基因注釋與功能分類
第九章 蛋白質(zhì)分析與蛋白質(zhì)組學(xué)
第十章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
第十一章 轉(zhuǎn)錄調(diào)控的信息學(xué)分析
第十二章 生物分子網(wǎng)絡(luò)
第十三章 計算表觀遺傳學(xué)
第三篇 生物信息學(xué)與人類復(fù)雜疾病
第十四章 人類復(fù)雜疾病與計算機(jī)系統(tǒng)生物學(xué)
第十五章 單核苷酸多態(tài)與人類疾病
第十六章 miRNA與復(fù)雜疾病
中英文對照索引
英中文對照索引
附錄 藥物生物信息學(xué)

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